Индекс mysql замирает через время

Пробовал разные Manticore от 3,5 до 5. База InnoDB, 6М - 20Gb
Пробовал через mysql.sock и sql_host
Индексы стоят, база проверена и оптимизирована.
Ситуация началась когда база обновилась до 6М записей, ранее было 2М было все ОК.
При индексе до 800К-1М индексирует нормально, быстро потом замирает и очень долго сканирует по 1000 doc в 2-5 минуты, пробовал разбить на 12 частей, индекс замирает уже на 86000 docs, 18.0 MB .

Понимаю что дело не в Manticore, но что подскажите куда копать

Посмотрите SHOW PROCESSLIST в mysql в момент замирания индексации. Возможно запрос к mysql просто долго отрабатывает и тогда его и надо оптимизировать. Обычно Manticore Search Manual: Adding data from external storages > Fetching from databases > Ranged queries помогает.